l、菌種保藏(Culture Collection)具有雙重的意義，一是指對微生物菌種作妥善的保藏，以便隨時(shí)可以取用；二是指專(zhuān)門(mén)從事菌種保藏的機構和組織。在科技發(fā)展的今日，菌種(Culture)及其保藏在范圍上已有很大的擴展，因此，現在常用的組合詞，菌種保藏已意味著(zhù)是指菌種及其相關(guān)生物材料的保藏。近年來(lái)，國內外有關(guān)人士常將菌種的覆蓋面擴大為生物資源(Biological resources)。菌種保藏機構常稱(chēng)作生物資源中心(BRC)，如美國模式培養物保藏中心(American Type Culture Collection)已自稱(chēng)為全球生物資源中心(Global Biologicol Resouree Center)，這是該中心自認為其對微生物資源的保藏和應用具有全球性意義，事實(shí)上，也確實(shí)如此，該中心的微生物資源保藏量與保藏種類(lèi)在世界上可說(shuō)是首屈一指的，但是在微生物資源的保藏量上可能不一定如此。據說(shuō)，從菌種保藏數量上而言，有些大企業(yè)的擁有量可能超過(guò)ATCC。
    2、為了具有自主知識產(chǎn)權，企業(yè)在微生物資源保藏量上數量龐大是因為企業(yè)要從大量資源中作高通量篩選，每一獨立的候選資源都在一定時(shí)間內涉及保藏問(wèn)題，另一方面，對于主產(chǎn)品的微生物資源的保藏其要求和技術(shù)條件均十分苛刻，這是不難理解的。
    3、在我國，涉及微生物肥料的生物資源正在不斷的擴大，資源的有效利用正在不斷的改善和提高，我國農業(yè)部直接領(lǐng)導的“微生物肥料和食用菌菌種質(zhì)量監督檢測中心”在推動(dòng)我國微生物肥料和食用菌的發(fā)展和質(zhì)量監控方面作了許多有益的工作。北京九隆升微生物資源開(kāi)發(fā)有限公司是一家專(zhuān)業(yè)從事農用微生物系列產(chǎn)品開(kāi)發(fā)的高新技術(shù)企業(yè)，公司本著(zhù)自主創(chuàng )新的原則，多渠道搜求微生物資源，包括自主分離篩選、購買(mǎi)、交換和友情引進(jìn)，現在累集了可觀(guān)的數量，而且均有妥善的保藏。
    4、企業(yè)擁有的菌種，尤其是生產(chǎn)菌種的保藏與一般大規模的菌種保藏有別，對企業(yè)的生產(chǎn)菌種，要求確保存活，不污染和生產(chǎn)特性保持穩定。第一，不言而喻，存活是首要的，第二，不污染是必須確保的，稍有疏忽被污染的菌種，如進(jìn)入下一步生產(chǎn)程序將給企業(yè)造成不可挽回的損失，確保不污染的菌種才能投入生產(chǎn)是企業(yè)的不二準則，第三，生產(chǎn)特性保持穩定具有雙向意義，菌種保藏妥善，其遺傳性狀保持穩定，生產(chǎn)性能保持正常是保藏技術(shù)的問(wèn)題，而生產(chǎn)工藝的穩定則是發(fā)揮和再現菌種生產(chǎn)特性的必要條件，往往菌種保藏是妥善的，而生產(chǎn)工藝上出現了問(wèn)題，如原料的改變影響了產(chǎn)量，生產(chǎn)過(guò)程中的污染而非菌種的原種被污染等等，發(fā)生此類(lèi)情況，企業(yè)有關(guān)部門(mén)必須冷靜，實(shí)事求是的予以分析，找出確切原因，劃清責任，避免菌種室和生產(chǎn)車(chē)間之間的相互推諉，以辨別是非，杜絕事故，達到改進(jìn)生產(chǎn)的目的。
    5、微生物肥料的生產(chǎn)、應用與其它微生物資源的利用如生產(chǎn)抗生素有別，后者是生產(chǎn)微生物的代謝產(chǎn)物，在生物資源上只需注意該資源的產(chǎn)出即可，即最終產(chǎn)物的質(zhì)與量。微生物肥料的生產(chǎn)當然也有終產(chǎn)品是資源的代謝產(chǎn)物，如生物生長(cháng)調節劑等等，但在許多情況下，資源的終產(chǎn)物是資源本身的擴繁，并將終產(chǎn)品用于田間、水域等，而且要求它們在應用的環(huán)境下發(fā)揮作用，這對資源(或稱(chēng)作菌種)保持本性有更高的要求，一株經(jīng)久保藏和經(jīng)過(guò)多代移植的菌種用于微生物肥料的生產(chǎn)應用，常常會(huì )出現施用于環(huán)境時(shí)的生態(tài)競爭能力下降，因此，菌種復壯就成為必要和微生物肥料生產(chǎn)中的特殊問(wèn)題。一株抗生素產(chǎn)生菌需經(jīng)過(guò)復雜的選育過(guò)程，結果其選育株與原始菌種相比較，可能面目全非，但只要其產(chǎn)生的抗生素結構穩、產(chǎn)量高，那是可行的。但微生物肥料，特別是直接用有益菌施用作肥料的菌種，在菌種選育和應用上就顯得另有要求，即最終的選育菌種必須在它們回歸到田間或水域時(shí)仍然是合格、有效的。