地衣芽孢桿菌（Bacillus licheniformis）和枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）均為用途廣泛的菌種，兩者都能產(chǎn)生芽孢，處于一種休眠的狀態(tài)，免受外界環(huán)境對自身活性的影響，等條件符合時(shí)有能脫掉芽孢，成為活菌。但兩者生長(cháng)情況不同，地衣比枯草要生長(cháng)的慢些，培養的時(shí)間上要長(cháng)些；兩者在產(chǎn)酶方面也有不同，枯草產(chǎn)淀粉酶和纖維素酶多點(diǎn)，地衣產(chǎn)蛋白酶多些。作用原理上都基本相同。在菌落、菌體形態(tài)上難以完全區分，在實(shí)踐中發(fā)現某些表型形狀可用于區分這兩種菌：

某些表型形狀的具體方法可參考微生物鑒定工具書(shū)。

需要注意的是，以上列舉的性質(zhì)不具有絕對性，某些菌株并不符合以上列舉的特性，例如目前已發(fā)現一些枯草芽孢桿菌的菌株可以在55℃下生長(cháng)。因此鑒定一個(gè)可疑菌株時(shí)，最好通過(guò)16S rDNA序列來(lái)判斷是地衣芽孢桿菌還是枯草芽孢桿菌。